MBMB juga ada menyediakan kaunter pembayaran untuk memudahkan orang awam membayar bil-bil yang dikeluarkan seperti bil cukai taksiran harta, sewaan gerai, bayaran letak kereta, lesen perniagaan dan sebagainya. Selain dari bil-bil yang dikeluarkan, orang awam juga boleh membayar bil-bil lain seperti bil telefon, api dan air.

Lapan kaunter pembayaran di sediakan dan di kendalikan dengan menggunakan satu Sistem Giliran. Kesemua kaunter ini diletakkan di bawah Jabatan Kewangan dan dibuka juga pada setiap hari Sabtu dari jam 8.30 pagi sehingga 1.00 tengahari.